Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700024B05RikE9Q6D7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700024B05RikE9Q6D7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700024B05RikE9Q6D7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700024B05RikE9Q6D7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700024B05RikE9Q6D7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700024B05RikE9Q6D7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700024B05RikE9Q6D7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700024B05RikE9Q6D7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms