Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtproE9Q612 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtproE9Q612 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtproE9Q612 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtproE9Q612 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms