Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2237E9Q501 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2237E9Q501 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2237E9Q501 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2237E9Q501 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2237E9Q501 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2237E9Q501 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2237E9Q501 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2237E9Q501 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2237E9Q501 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2237E9Q501 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms