Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms