Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pgbd1E9Q492 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pgbd1E9Q492 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pgbd1E9Q492 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms