Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Tarbp1E9Q368 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tarbp1E9Q368 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tarbp1E9Q368 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tarbp1E9Q368 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Tarbp1E9Q368 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tarbp1E9Q368 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tarbp1E9Q368 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tarbp1E9Q368 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms