Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd4E9Q2E4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hectd4E9Q2E4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd4E9Q2E4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hectd4E9Q2E4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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