Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r88E9Q235 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn1r88E9Q235 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r88E9Q235 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r88E9Q235 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r88E9Q235 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r88E9Q235 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r88E9Q235 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms