Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp558E9Q1J0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp558E9Q1J0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp558E9Q1J0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp558E9Q1J0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp558E9Q1J0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp558E9Q1J0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp558E9Q1J0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp558E9Q1J0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp558E9Q1J0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp558E9Q1J0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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