Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcom1E9PZ54 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcom1E9PZ54 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gcom1E9PZ54 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcom1E9PZ54 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gcom1E9PZ54 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms