Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp944E9PUS4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp944E9PUS4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp944E9PUS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp944E9PUS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zfp944E9PUS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms