Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clca3bE9PUL3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clca3bE9PUL3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clca3bE9PUL3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clca3bE9PUL3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clca3bE9PUL3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clca3bE9PUL3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clca3bE9PUL3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clca3bE9PUL3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms