Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim12cD3Z3L3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim12cD3Z3L3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim12cD3Z3L3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim12cD3Z3L3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim12cD3Z3L3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim12cD3Z3L3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim12cD3Z3L3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim12cD3Z3L3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim12cD3Z3L3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim12cD3Z3L3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms