Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm42791D3YYB5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm42791D3YYB5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm42791D3YYB5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm42791D3YYB5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm42791D3YYB5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm42791D3YYB5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.5 ms