Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rexo5D3YW29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rexo5D3YW29 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rexo5D3YW29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rexo5D3YW29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rexo5D3YW29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rexo5D3YW29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rexo5D3YW29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms