Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d4D3YUH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d4D3YUH6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms