Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga9B8JK39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga9B8JK39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga9B8JK39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga9B8JK39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itga9B8JK39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga9B8JK39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 818 ms