Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm5483B2RV77 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5483B2RV77 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5483B2RV77 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5483B2RV77 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5483B2RV77 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5483B2RV77 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5483B2RV77 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5483B2RV77 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms