Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrt4B2RU40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrt4B2RU40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrt4B2RU40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrt4B2RU40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrt4B2RU40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrt4B2RU40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms