Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lonrf2B2RT44 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lonrf2B2RT44 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf2B2RT44 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lonrf2B2RT44 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf2B2RT44 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf2B2RT44 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf2B2RT44 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms