Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CK137956B1AYM9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CK137956B1AYM9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CK137956B1AYM9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CK137956B1AYM9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CK137956B1AYM9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms