Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Grik3B1AS29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grik3B1AS29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Grik3B1AS29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Grik3B1AS29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grik3B1AS29 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grik3B1AS29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Grik3B1AS29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Grik3B1AS29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms