Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm11569B1AQB1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm11569B1AQB1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm11569B1AQB1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm11569B1AQB1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm11569B1AQB1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm11569B1AQB1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm11569B1AQB1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm11569B1AQB1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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