Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A630010A05RikA9C473 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A630010A05RikA9C473 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A630010A05RikA9C473 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A630010A05RikA9C473 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A630010A05RikA9C473 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A630010A05RikA9C473 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms