Protein–RNA interactions for Protein: A6H6Q4

Uncharacterized protein C19orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6H6Q4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6H6Q4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6H6Q4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6H6Q4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6H6Q4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6H6Q4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6H6Q4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6H6Q4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6H6Q4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6H6Q4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6H6Q4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6H6Q4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6H6Q4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6H6Q4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6H6Q4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6H6Q4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6H6Q4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6H6Q4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6H6Q4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6H6Q4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6H6Q4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6H6Q4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6H6Q4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6H6Q4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6H6Q4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6H6Q4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6H6Q4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6H6Q4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6H6Q4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6H6Q4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms