Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Patl2A2ARM1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Patl2A2ARM1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Patl2A2ARM1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Patl2A2ARM1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Patl2A2ARM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Patl2A2ARM1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Patl2A2ARM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms