Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hivep3A2A884 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hivep3A2A884 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hivep3A2A884 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hivep3A2A884 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hivep3A2A884 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep3A2A884 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep3A2A884 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep3A2A884 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep3A2A884 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms