Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo47A2A6H3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo47A2A6H3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo47A2A6H3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo47A2A6H3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxo47A2A6H3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo47A2A6H3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms