Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul4bA2A432 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul4bA2A432 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cul4bA2A432 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul4bA2A432 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul4bA2A432 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms