Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp1bA1Z198 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp1bA1Z198 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp1bA1Z198 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1bA1Z198 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1bA1Z198 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1bA1Z198 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp1bA1Z198 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms