Protein–RNA interactions for Protein: A1L3P4

Slc9a6, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a6A1L3P4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a6A1L3P4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a6A1L3P4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a6A1L3P4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a6A1L3P4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a6A1L3P4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 834.2 ms