Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm28171A0A087WQ19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gm28171A0A087WQ19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gm28171A0A087WQ19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gm28171A0A087WQ19 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms