Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 CRYGA-201ENST00000304502 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC074254.1-201ENST00000399152 404 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC084879.1-201ENST00000636165 1201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SMIM3Q9BZL3 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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