Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC007066.2-201ENST00000561961 1993 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms