Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema4fQ9Z123 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema4fQ9Z123 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms