Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RRBP1Q9P2E9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms