Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms