Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sft2d3Q9CSV6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sft2d3Q9CSV6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sft2d3Q9CSV6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sft2d3Q9CSV6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sft2d3Q9CSV6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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