Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms