Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MESP1Q9BRJ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms