Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy1Q8BIJ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms