Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUB1	Q6Q546	YPL229W	YPL229W	621 nt		-2.43	□□□□□ -2.8
HUB1	Q6Q546	CSE2	YNR010W	450 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
HUB1	Q6Q546	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
HUB1	Q6Q546	VPS20	YMR077C	666 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
HUB1	Q6Q546	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	YLR217W	YLR217W	324 nt		-2.5	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	snR81	snR81	201 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	YOR121C	YOR121C	306 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	YFL012W	YFL012W	447 nt		-2.53	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		-2.53	□□□□□ -2.81
HUB1	Q6Q546	YDR544C	YDR544C	429 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	YAF9	YNL107W	681 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	GPI15	YNL038W	690 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	TOM22	YNL131W	459 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	YBR285W	YBR285W	435 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	YNL266W	YNL266W	420 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	snR39B	snR39B	96 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	YBL071C	YBL071C	309 nt		-2.58	□□□□□ -2.82
HUB1	Q6Q546	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-2.6	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	snR77	snR77	88 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	snR9	snR9	187 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	BI2	Q0110	1272 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	PCC1	YKR095W-A	267 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	PRM3	YPL192C	402 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		-2.63	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	YGR069W	YGR069W	336 nt		-2.64	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	snR50	snR50	90 nt		-2.64	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	YNL205C	YNL205C	423 nt		-2.65	□□□□□ -2.83
HUB1	Q6Q546	YKL044W	YKL044W	321 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
HUB1	Q6Q546	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
HUB1	Q6Q546	RDS3	YPR094W	324 nt		-2.69	□□□□□ -2.84
HUB1	Q6Q546	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-2.73	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-2.74	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	snR69	snR69	101 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	YDL016C	YDL016C	303 nt		-2.77	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	snR34	snR34	203 nt		-2.77	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	YIL029C	YIL029C	429 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
HUB1	Q6Q546	RPS27B	YHR021C	249 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
HUB1	Q6Q546	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
HUB1	Q6Q546	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
HUB1	Q6Q546	YLR202C	YLR202C	327 nt		-2.84	□□□□□ -2.86
HUB1	Q6Q546	YLR269C	YLR269C	351 nt		-2.86	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	HMRA1	YCR097W	381 nt		-2.87	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-2.87	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	snR67	snR67	82 nt		-2.88	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	YAR047C	YAR047C	321 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	YDR048C	YDR048C	315 nt		-2.9	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	YGL149W	YGL149W	306 nt		-2.9	□□□□□ -2.87
HUB1	Q6Q546	YDR102C	YDR102C	333 nt		-2.95	□□□□□ -2.88
HUB1	Q6Q546	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
HUB1	Q6Q546	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-2.99	□□□□□ -2.89
HUB1	Q6Q546	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-2.99	□□□□□ -2.89
HUB1	Q6Q546	YOR309C	YOR309C	381 nt		-3	□□□□□ -2.89
HUB1	Q6Q546	EAF6	YJR082C	342 nt		-3.02	□□□□□ -2.89
HUB1	Q6Q546	CSN9	YDR179C	489 nt		-3.06	□□□□□ -2.9
HUB1	Q6Q546	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		-3.14	□□□□□ -2.91
HUB1	Q6Q546	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-3.17	□□□□□ -2.92
HUB1	Q6Q546	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		-3.2	□□□□□ -2.92
HUB1	Q6Q546	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-3.2	□□□□□ -2.92
HUB1	Q6Q546	YER097W	YER097W	330 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
HUB1	Q6Q546	YDR543C	YDR543C	300 nt		-3.28	□□□□□ -2.93
HUB1	Q6Q546	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-3.28	□□□□□ -2.93
HUB1	Q6Q546	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-3.28	□□□□□ -2.93
HUB1	Q6Q546	MPC1	YGL080W	393 nt		-3.3	□□□□□ -2.94
HUB1	Q6Q546	YDL158C	YDL158C	309 nt		-3.31	□□□□□ -2.94
HUB1	Q6Q546	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-3.31	□□□□□ -2.94
HUB1	Q6Q546	ATP19	YOL077W-A	207 nt		-3.32	□□□□□ -2.94
HUB1	Q6Q546	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-3.33	□□□□□ -2.94
HUB1	Q6Q546	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-3.36	□□□□□ -2.95
HUB1	Q6Q546	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-3.37	□□□□□ -2.95
HUB1	Q6Q546	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-3.37	□□□□□ -2.95
HUB1	Q6Q546	YFL019C	YFL019C	354 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
HUB1	Q6Q546	YFL032W	YFL032W	321 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
HUB1	Q6Q546	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
HUB1	Q6Q546	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-3.43	□□□□□ -2.96
HUB1	Q6Q546	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-3.44	□□□□□ -2.96
HUB1	Q6Q546	YBR178W	YBR178W	375 nt		-3.46	□□□□□ -2.96
HUB1	Q6Q546	YKL063C	YKL063C	504 nt		-3.47	□□□□□ -2.96
HUB1	Q6Q546	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-3.47	□□□□□ -2.96
HUB1	Q6Q546	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-3.48	□□□□□ -2.97
HUB1	Q6Q546	snR60	snR60	104 nt		-3.49	□□□□□ -2.97
HUB1	Q6Q546	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		-3.54	□□□□□ -2.98
HUB1	Q6Q546	snR54	snR54	86 nt		-3.54	□□□□□ -2.98
HUB1	Q6Q546	ATP6	Q0085	780 nt		-3.56	□□□□□ -2.98
HUB1	Q6Q546	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-3.61	□□□□□ -2.99
HUB1	Q6Q546	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-3.61	□□□□□ -2.99
HUB1	Q6Q546	YJR157W	YJR157W	363 nt		-3.62	□□□□□ -2.99
HUB1	Q6Q546	YNL324W	YNL324W	396 nt		-3.65	□□□□□ -2.99
HUB1	Q6Q546	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-3.66	□□□□□ -3
HUB1	Q6Q546	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-3.67	□□□□□ -3
HUB1	Q6Q546	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-3.69	□□□□□ -3
HUB1	Q6Q546	YAL066W	YAL066W	309 nt		-3.69	□□□□□ -3
HUB1	Q6Q546	YLR434C	YLR434C	384 nt		-3.69	□□□□□ -3

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