Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC4Q6P2E9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms