Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN13Q12923 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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