Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 RKR1YMR247C 4689 nt0.94□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 YOL014WYOL014W 375 nt0.93□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.92□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 YEL014CYEL014C 306 nt0.91□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 snR190snR190 190 nt0.91□□□□□ -2.26
SSP2Q08646 APQ12YIL040W 417 nt0.9□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YOR345CYOR345C 351 nt0.9□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.9□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 COY1YKL179C 2040 nt0.89□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.89□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.89□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 SEC1YDR164C 2175 nt0.89□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 COX5BYIL111W 456 nt0.87□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YLR282CYLR282C 342 nt0.87□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 CHS6YJL099W 2241 nt0.87□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.85□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.85□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.85□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 COX12YLR038C 252 nt0.85□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.85□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 HAL9YOL089C 3093 nt0.85□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.84□□□□□ -2.27
SSP2Q08646 FYV10YIL097W 1551 nt0.83□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YML002WYML002W 2214 nt0.83□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 PRP5YBR237W 2550 nt0.82□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 snR52snR52 92 nt0.82□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 MYO1YHR023W 5787 nt0.82□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.81□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YNL337WYNL337W 255 nt0.81□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 ULP2YIL031W 3105 nt0.81□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 UTP8YGR128C 2142 nt0.8□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 BEM3YPL115C 3387 nt0.8□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.79□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.78□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.78□□□□□ -2.28
SSP2Q08646 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.77□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.77□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 YLR041WYLR041W 321 nt0.77□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 OST4YDL232W 111 nt0.76□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 FMP27YLR454W 7887 nt0.76□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 BIR1YJR089W 2865 nt0.75□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 PRP42YDR235W 1635 nt0.75□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 YEL073CYEL073C 324 nt0.75□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 snR46snR46 197 nt0.75□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 YJL182CYJL182C 318 nt0.74□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 TRS65YGR166W 1683 nt0.72□□□□□ -2.29
SSP2Q08646 MLP1YKR095W 5628 nt0.71□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YJL150WYJL150W 303 nt0.71□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YNL198CYNL198C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YSP1YHR155W 3687 nt0.7□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.7□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 PET111YMR257C 2403 nt0.69□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YGR151CYGR151C 336 nt0.69□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 AI1Q0050 2505 nt0.69□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 TAH1YCR060W 336 nt0.67□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.67□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YLR232WYLR232W 348 nt0.67□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 PRP39YML046W 1890 nt0.66□□□□□ -2.3
SSP2Q08646 Q0032Q0032 291 nt0.65□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 IQG1YPL242C 4488 nt0.64□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 SNU13YEL026W 381 nt0.64□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YGL182CYGL182C 324 nt0.64□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.63□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.62□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.62□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 NNF2YGR089W 2811 nt0.61□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.61□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YNL338WYNL338W 159 nt0.61□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YDR544CYDR544C 429 nt0.6□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.6□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
SSP2Q08646 YOR170WYOR170W 306 nt0.56□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 SBH1YER087C-B 249 nt0.55□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.55□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 YOR102WYOR102W 351 nt0.55□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.55□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 BUL2YML111W 2763 nt0.55□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 MLP2YIL149C 5040 nt0.54□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 YOR225WYOR225W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.53□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.53□□□□□ -2.32
SSP2Q08646 NIP1YMR309C 2439 nt0.53□□□□□ -2.33
SSP2Q08646 COG6YNL041C 2520 nt0.52□□□□□ -2.33
SSP2Q08646 RPS26AYGL189C 360 nt0.52□□□□□ -2.33
SSP2Q08646 THO2YNL139C 4794 nt0.52□□□□□ -2.33
SSP2Q08646 SDH6YDR379C-A 240 nt0.51□□□□□ -2.33
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