Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YER053C-AYER053C-A 114 nt1□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 PRP39YML046W 1890 nt1□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 TRS65YGR166W 1683 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 SMC1YFL008W 3678 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YPL044CYPL044C 549 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 RKR1YMR247C 4689 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 Q0032Q0032 291 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YNL338WYNL338W 159 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YBL053WYBL053W 375 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 YDL073WYDL073W 2955 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 YLR282CYLR282C 342 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 PRP16YKR086W 3216 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 YLR294CYLR294C 330 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 snR190snR190 190 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN11Q04712 RPL26BYGR034W 384 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 COX5BYIL111W 456 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YEL073CYEL073C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 PRP42YDR235W 1635 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 FYV10YIL097W 1551 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YLR041WYLR041W 321 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YML002WYML002W 2214 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 PRP5YBR237W 2550 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN11Q04712 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YMR160WYMR160W 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YGL182CYGL182C 324 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 CHS6YJL099W 2241 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 TAH1YCR060W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YDR544CYDR544C 429 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 PAU12YGR294W 363 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 PAU24YBR301W 363 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 SEC8YPR055W 3198 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 UTP8YGR128C 2142 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN11Q04712 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 OST4YDL232W 111 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 SNU13YEL026W 381 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 LTE1YAL024C 4308 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 QCR9YGR183C 201 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YLR232WYLR232W 348 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YOR102WYOR102W 351 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YOR170WYOR170W 306 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 snR39BsnR39B 96 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 snR48snR48 113 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN11Q04712 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.71□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 BIR1YJR089W 2865 nt0.71□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 SEC1YDR164C 2175 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 COG6YNL041C 2520 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 SDH6YDR379C-A 240 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 ULP2YIL031W 3105 nt0.65□□□□□ -2.3
RRN11Q04712 YDR210WYDR210W 228 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YSP1YHR155W 3687 nt0.62□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YOL014WYOL014W 375 nt0.62□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 BEM3YPL115C 3387 nt0.61□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 BUL2YML111W 2763 nt0.61□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YGR164WYGR164W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 NNF2YGR089W 2811 nt0.61□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 THO2YNL139C 4794 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN11Q04712 ATP8Q0080 147 nt0.59□□□□□ -2.31
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