Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms