Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms