Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx2P81066 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms