Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ErfP70459 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ErfP70459 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ErfP70459 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ErfP70459 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ErfP70459 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms